相關(guān)報告指出，分層之后，交易機制的設(shè)計仍然是重大難題。

6月27日，新三板分層后首個交易日，全市場掛牌公司股票成交8.52億元，其中，做市方式轉(zhuǎn)讓的股票成交4.33億元。當日，創(chuàng)新層953只股票中，460只股票有成交記錄，成交6042.74萬股，成交規(guī)模為5.09億元，占全市場交易額接近六成，為59.74%。目前創(chuàng)新層有633只做市股票，320只協(xié)議轉(zhuǎn)讓股票。

于2015年2月12日掛牌新三板、今年5月17日轉(zhuǎn)為做市轉(zhuǎn)讓方式的經(jīng)證投資（證券代碼832051）也入圍了創(chuàng)新層。5月17日，經(jīng)證投資做市轉(zhuǎn)讓首日實現(xiàn)逆勢上揚，當日成交177.20萬股，成交1446.18萬元，當日換手率達到1.79%。自今年5月17日轉(zhuǎn)入做市轉(zhuǎn)讓方式以來至6月27日收盤，已經(jīng)累計成交338萬股，成交金額為2661.62萬元。

雖然創(chuàng)新層股票成交規(guī)模近六成，但作為新三板標桿性市場指數(shù)，三板做市指數(shù)昨日收報1145.81點，下跌5.84點，跌幅為0.51%，做市股票成交4.38億元。

盡管此前全國股轉(zhuǎn)系統(tǒng)表示，“掛牌公司分層與解決市場流動性沒有必然聯(lián)系。全國股轉(zhuǎn)系統(tǒng)高度重視市場流動性問題，目前正根據(jù)市場的發(fā)展情況，研究解決流動性的措施”。但市場參與者仍期待提高流動性，并且提高流動性已經(jīng)成為迫切需要。

近日由金融法律與金融監(jiān)管研究基地（FLR）撰寫完成的《中國金融監(jiān)管報告（2016）》認為，從流動性改善看，分層機制對于整個市場的流動性改善有待觀察。如果新三板市場的供求匹配存在巨大錯配，交易定價機制不合理，市場融資及服務(wù)實體經(jīng)濟的功能不凸顯，那么，處于創(chuàng)新層的掛牌公司慢慢地也會被市場的體制機制問題所影響，其流動性亦會慢慢被消蝕，而處于基礎(chǔ)層的掛牌公司甚至會慢慢滑入無人問津的底部。分層制度實際上并不帶來市場流動性的增加，只是改變了市場流動性的結(jié)構(gòu)。

上述報告認為，新三板分層之后，為了適應(yīng)創(chuàng)新層的發(fā)展，交易機制的設(shè)計仍然是一個重大的難題。從交易機制設(shè)計上來看，如果還是延續(xù)做市商制度，那么需要加快解決做市商制度的諸多問題，或者考慮是否能夠在創(chuàng)新層引入競價交易體系。